EclipseでJAR出力

EclipseでJARファイルを出力する時に、ソースファイルも出力すると、
クラスファイルと同じディレクトリに出力されてしまう。
ソースはsrcディレクトリにあるので、srcディレクトリのまま出力できないのか？
オプションがいくつかあるがよくわからない。